Biblioteke napisane u Nextflow u
rnaseq
Cjevovod analize sekvenciranja RNA koristeći STAR, RSEM, HISAT2 ili Salmon s brojem gena/izoforme i opsežnom kontrolom kvalitete.
- 646
- MIT
sarek
Cjevovod analize za otkrivanje germinativne ili somatske varijante (pretprocesiranje, pozivanje varijante i označavanje) iz WGS-a / ciljanog sekvenciranja.
- 256
- MIT
configs
Konfiguracijske datoteke koje se koriste za definiranje parametara specifičnih za računalna okruženja u različitim institucijama (od strane nf-core).
- 71
- MIT